Seto lipp oli valitud 2003. aastal Obinitsas toimunud 7. Seto Kongressil ning õnnistatud Värska kirikus toonase preestri isa Andrease poolt. Sootska oli Evar Riitsaar. Õnnistamise järel sai iga seto leelokoor endale ühe lipu.
Seto lipu teemal oli nõu peetud nii kunstnike kui ka heraldikutega ning kõik huvitatud on ajalehe «Setomaa» kaudu saanud võimaluse avaldada arvamust nelja lipukavandi kohta.
Kongressil olid hääletusel kõik neli lipukavandit.
Seto majalippu on võimalik endale osta Värska turismiinfopunktis hinnaga 690.- krooni.